国务院于2005年12月19日相应修订了《中华人民共和国个人所得税法实施条例》，明确了单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金（“三费一金”）从个人收入中扣除，不缴纳个人所得税。

随后，财政部、国家税务总局联合下发《关于基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金有关个人所得税政策的通知》财税[2006]10号（以下简称《通知》），根据《通知》精神，单位为个人缴付和个人缴付的住房公积金从个人收入中扣除，不缴纳个人所得税。《通知》同时规定，住房公积金缴存标准高于《通知》规定标准的，其超标准部分要计征个人所得税；地方擅自对超标准的住房公积金免税的，财政、税务机关应坚决予以纠正。

《通知》规定的标准是什么呢？

其第二款规定，单位和个人分别在不超过职工本人上一年度月平均工资12%的幅度内，其实际缴存的住房公积金，允许在个人应纳税所得额中扣除。单位和职工个人缴存住房公积金的月平均工资不得超过职工工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资的3倍，具体标准按照各地有关规定执行。

而这个标准正是根据建设部、财政部、中国人民银行下发的《关于住房公积金管理若干具体问题的指导意见》（建金管[2005]5号）有关“设区城市（主要指地级市）单位和职工缴存比例最低不低于5%，最高不高于12%（合计缴存比例为10%至24%），缴存基数仍为职工本人上一年度月平均工资，同时，对高收入行业及个人缴存基数限制为不超过当地职工社会平均工资的2至3倍”的规定得来的。

此前，《住房公积金管理条例》只规定了单位和个人缴纳住房公积金的下限，上不封顶，导致不同地区、行业、企业住房公积金缴存情况差距较大，经济落后地区、效益不好的企业甚至经常拖欠职工的住房公积金，一些效益较好的单位利用公积金免税的政策，有意将一些应税福利打入"住房公积金"账户逃税。

《通知》按照建设部、财政部、中国人民银行建金管[2005]5号文件缴存住房公积金的标准规定税收政策，使住房公积金的税收政策与公积金主管部门有关规定一致，保证了各项相关政策的统筹协调。